입안의 질병: 대부분의 입 냄새는 입안에서 생기며 구강위생이 불량하거나 충치, 치석, 음식찌꺼기 등에의해 세균이 자라서 발생한다. 가장 흔한 원인은 만성적인 치주염이이 그원인이다. 구내염이나 설명을 잘 일으키는 경우 악취가나는 원인이 되기도 한다.
전신질환: 신부전에 의한 요독증에서는 숨쉴 때마다 소변냄새나 암모니아 냄새가 나는데 이 냄새는 생선비린내와 비슷하다. 간경화증, 고열이나 탈수는 침의 분비를 적게하므로 입 냄새를 악화시킨다.
위장질환 : 소화불량이나 역류성 식도질환 등의 환자들에게서도 입 냄새가 날 수 있다.
코의질환 : 비염과 같이 코 속에 이상이 있으면 세균이 잘 자라고 그 때문에 악취가 생긴다.
폐의질환 : 기관지염, 폐렴, 결핵, 폐암 등으로 호흡시 냄새가 유발 될 수 있다.